Ang nobelang “El Filibusterismo” ay isang pagpapatuloy sa kuwento ng “Noli Me Tangere.” Sa nobelang ito, makikilala natin si Simoun, ang dating Crisostomo Ibarra, na bumalik sa Pilipinas pagkatapos ng pitong taong pag-aaral sa Europa. Bagamat nagbabalik siya bilang isang mayamang negosyante, may itinatagong galit at hangarin si Simoun na bumalik sa bansa para paghigantihan ang mga prayle at opisyal ng pamahalaan.

Sa pagkakataong ito, ang nobela ay naglalakbay sa San Diego, kung saan tayo ay na-introduce sa iba’t ibang karakter na may kaugnayan sa mga pangunahing tauhan. Si Basilio, dating batang inaalagaan ni Sisa, ay nagtratrabaho bilang isang manggagamot at mayroong mga pangarap para sa kanyang kinabukasan. Makikilala rin natin si Isagani, isang masugid na estudyante at kaibigan ni Simoun, na may relasyon kay Paulita Gomez.

Sa buong nobela, ipinakita ang mga kasaysayan ng mga karakter mula sa “Noli Me Tangere” at kung paano ang kanilang mga buhay ay nagpatuloy. Isinasaalang-alang ni Simoun ang mga paraan upang magkaroon ng rebolusyon upang mapabagsak ang kasalukuyang pamahalaan at sistemang pangkapangyarihan ng mga Kastila.

Bilang bahagi ng kanyang mga plano, ipinakilala ni Simoun ang “El Filibusterismo,” isang aklat ng mga lihim na dokumento na naglalaman ng mga impormasyon ukol sa mga pang-aabuso ng mga opisyal at mga prayle. Sa pamamagitan nito, naglalayong buksan ang mga mata ng mga Pilipino sa tunay na kalagayan ng bansa.

Ang nobela ay patuloy na nagpapakita ng mga suliranin ng lipunan, kasama na ang pag-aalipusta sa mga Pilipino, ang kahirapan, at ang mga pag-aabuso ng mga nasa kapangyarihan. Ipinakikita nito ang mga pagpapasya at pagkilos ng mga tauhan na may layuning baguhin ang kanilang kapalaran at ang kinabukasan ng kanilang bayan.

Sa pag-usbong ng mga pangyayari, inilalabas ng nobela ang mga kabiguan at pag-aalinlangan ng mga karakter, pati na rin ang kanilang mga tagumpay at pag-asa. Hanggang sa dulo, natutunan ng mga tauhan ang mga halaga ng pagkakaibigan, pagkakaisa, at pag-aalay ng sarili para sa bayan.

Sa pagtatapos ng nobela, nagaganap ang marahas na klimaks na nagdudulot ng mga pagbabago sa mga buhay ng mga tauhan. Ipinapakita nito ang epekto ng kanilang mga desisyon at kilos sa kabuuan ng kuwento.

“El Filibusterismo” ay isang obra-maestra na nag-aalok ng sariwang pagtingin sa mga isyung panlipunan, pampolitika, at pangkultura na kinakaharap ng Pilipinas noong panahon ng kolonyalismong Kastila. Sa pamamagitan ng mga karakter at kuwento, ipinapakita nito ang mga pag-aalitang umiiral sa lipunan at ang pagpapalaganap ng mga ideya ng pagbabago, katarungan, at pag-asa.